More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1904 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  100 
 
 		 336 aa  675    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  62.39 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  60.76 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  58.54 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  35.31 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.97 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.01 
 
 		 308 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  34.29 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.91 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.74 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  36.14 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  34.07 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  32.04 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.01 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  34.8 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.78 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  32.69 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  32.26 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  32.58 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.24 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  31.41 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  30.77 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  32.97 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.36 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.66 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  32.62 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.28 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  29.45 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  27.65 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  32.36 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  32.4 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.89 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.17 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  29.81 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.48 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.39 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  28.8 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.87 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  29.54 
 
 		 316 aa  99.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  34.22 
 
 		 312 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  35.74 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  36.74 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  36.74 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  35.36 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  29.72 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  33.21 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  36.12 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  29.72 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  36.6 
 
 		 316 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.44 
 
 		 304 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.12 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.57 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.57 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.57 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  32.29 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  32.29 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 311 aa  93.6  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  32.67 
 
 		 313 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  32.81 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  32.28 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.47 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  33.86 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  32.32 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  32.79 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  29.14 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  32.48 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  32.19 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  32.1 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  26.71 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  29.97 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  31.87 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.71 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.14 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  30.99 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  29.52 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  32.82 
 
 		 308 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  31.65 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>