More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0544 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  58.54 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  56.25 
 
 		 344 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  55.49 
 
 		 332 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  36.25 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.66 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  32.91 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.37 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  32.17 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  32.4 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.69 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  34.25 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  32.92 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  30.89 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  33.33 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  30.99 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  35.16 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  32.92 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  32.97 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  31.72 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.38 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  30.48 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  29.26 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  34.17 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.62 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  34.19 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  34.19 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  32.26 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  33.13 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  28.94 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  32.35 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  31.43 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  28.98 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  32.48 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  31.75 
 
 		 346 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  31.01 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  30.84 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  32.17 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  32.18 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  31.17 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  32.19 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  32.32 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  29.72 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  31.56 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  30.54 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  33.82 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  30.86 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  31.65 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  29.91 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  31.77 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  30.63 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.69 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  32.04 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  31.91 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  29.22 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  24.62 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  24.48 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  29.66 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  30.28 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  29.71 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  32.21 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  23.64 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  31.25 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  25.79 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  21.94 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  29.78 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  27.74 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.1 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  25.79 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.8 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>