More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0921 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  45.13 
 
 
306 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  42.81 
 
 
306 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  42.81 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  37.1 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  42.81 
 
 
306 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  40.84 
 
 
306 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  43.14 
 
 
308 aa  208  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  41.45 
 
 
308 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  40.32 
 
 
308 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  40 
 
 
308 aa  201  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  40.33 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  39.68 
 
 
308 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  39.34 
 
 
308 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  42.12 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  42.76 
 
 
322 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  40.32 
 
 
322 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 
310 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  39.6 
 
 
308 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  41.12 
 
 
314 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  39.09 
 
 
306 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.11 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  39.94 
 
 
319 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  38.17 
 
 
316 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  41.2 
 
 
313 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  43.22 
 
 
312 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  37.99 
 
 
312 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  38.17 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  37.34 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.02 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  37.05 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  36.81 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  37.85 
 
 
321 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  34.39 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  40.13 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
317 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  36.69 
 
 
326 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  35.33 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  36.31 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  38.54 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  34.52 
 
 
326 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  37.7 
 
 
311 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.87 
 
 
312 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 
320 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  33.44 
 
 
329 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  37.25 
 
 
310 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  39.42 
 
 
315 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  36.13 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  37.18 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  35.62 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  33.33 
 
 
323 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  36.72 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  34.78 
 
 
320 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  36.27 
 
 
307 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  34.75 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
319 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  38.25 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  37.89 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  34.97 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  34.66 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  37.15 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  35.14 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  38.61 
 
 
310 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  36.72 
 
 
309 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 
326 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  36.75 
 
 
332 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 
319 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  33.81 
 
 
311 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  35.86 
 
 
306 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.62 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  35.05 
 
 
316 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
319 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  31.58 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.94 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  36.18 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  35.86 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  31.58 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.82 
 
 
320 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  35.86 
 
 
316 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  32 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  28.8 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  31.97 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  28.8 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  36.98 
 
 
302 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  31.01 
 
 
319 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  34.95 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  34.95 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  34.95 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  34.95 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>