More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3042 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  62.01 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  59.35 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  57.93 
 
 		 306 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  57.14 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  57.28 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  54.22 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  53.9 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  53.25 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  53.57 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  49.03 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  48.7 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  48.38 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  54.22 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  50.32 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  43.18 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  43.37 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  44.76 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  42.05 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  39.05 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  35.28 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  37.5 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  37.18 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  41.88 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  37.74 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  41.94 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  40.32 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  37.94 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  36.98 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.06 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  39.6 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  38.49 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  36.33 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  39.03 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  37.46 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  38.14 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  37.06 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  38.85 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  39.37 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  38.34 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  38.34 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  35.33 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  39.55 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  36.91 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  35.65 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  35.65 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 320 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  35.26 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  36.33 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  37.95 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  33.96 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  36.45 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.63 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  34.73 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  39.16 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  32.9 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  35.9 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.56 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  33.23 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  36.76 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  32.8 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.82 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  36.79 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.22 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  33.87 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  35.38 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  29.08 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  29.08 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  28.2 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  28.2 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.62 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.62 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.62 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.15 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.3 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  28.48 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  35.03 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.9 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  34.46 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.76 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  30.38 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.18 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>