More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2919 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  97.1 
 
 		 310 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  83.23 
 
 		 321 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  70.32 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  64.42 
 
 		 312 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  63.78 
 
 		 312 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  61.86 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  58.79 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  55.59 
 
 		 323 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  46.75 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  47.27 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  44.37 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  47.1 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  40.45 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  38.71 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  40.78 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  42.12 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  36.45 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  36.77 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.71 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  41.08 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  36.45 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  35.81 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  40.13 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  38.74 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  36.33 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  31.83 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  38.22 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.91 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  37.42 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  35.14 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  38.38 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  37.38 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  35.96 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  35.28 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  36.48 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  38.78 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  40 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  38.02 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  36.62 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  35.33 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  34.94 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  35.39 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  37.96 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  32.26 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.72 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.65 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  34.77 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  33.97 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  35.83 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.49 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.46 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  32.26 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.27 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  31.39 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  30.7 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  30.56 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  30.56 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  30.56 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  32.91 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  31.41 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.28 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  29.43 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  36.62 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  30.71 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  35.09 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.54 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  35.61 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  29.81 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  36.68 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.62 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  35.07 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  35.93 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  26.33 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>