More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7023 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  48.89 
 
 
317 aa  272  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  49.84 
 
 
312 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  47.94 
 
 
309 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  49.35 
 
 
313 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 
311 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  40.97 
 
 
320 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  37.66 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  37.03 
 
 
321 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.06 
 
 
306 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  33.44 
 
 
308 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.12 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 
320 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
308 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  36.36 
 
 
326 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.95 
 
 
322 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  32.38 
 
 
329 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.58 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  31.17 
 
 
308 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  35.69 
 
 
316 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  31.17 
 
 
308 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  34.21 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 
306 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  34.18 
 
 
306 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  33.98 
 
 
306 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  35.53 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 
306 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.63 
 
 
307 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  34.85 
 
 
311 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  32.08 
 
 
303 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  30.65 
 
 
308 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  32.8 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  32.39 
 
 
322 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  33.45 
 
 
326 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.83 
 
 
309 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  32.9 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  35.09 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  35.31 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 
314 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  31.31 
 
 
303 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
306 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  32.65 
 
 
312 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  33.01 
 
 
346 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  33.12 
 
 
323 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  32.57 
 
 
338 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  30.6 
 
 
334 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 
316 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
319 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  31.73 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 
317 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  32.8 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  32.33 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  31.68 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  33.45 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  31.75 
 
 
317 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 
317 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.58 
 
 
322 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  31.75 
 
 
313 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  31.39 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.38 
 
 
312 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  33.56 
 
 
312 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  33.02 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 
312 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  30.62 
 
 
309 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  31.53 
 
 
310 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  32.78 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
309 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 
316 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30 
 
 
323 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
312 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  30.74 
 
 
311 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  30.57 
 
 
321 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  30.74 
 
 
312 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 
333 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
312 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  31.13 
 
 
316 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.4 
 
 
306 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  31.06 
 
 
284 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  31.54 
 
 
319 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.45 
 
 
313 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32 
 
 
307 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  32.28 
 
 
310 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.22 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.12 
 
 
313 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.07 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.07 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.07 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.22 
 
 
304 aa  99  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.95 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.71 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.64 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>