More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0836 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0836  PfkB  100 
 
 
306 aa  617  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  62.09 
 
 
308 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  64.05 
 
 
306 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  62.09 
 
 
306 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  62.09 
 
 
306 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  59.48 
 
 
308 aa  358  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  59.15 
 
 
308 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  58.17 
 
 
308 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  56.54 
 
 
308 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  55.23 
 
 
308 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  55.56 
 
 
308 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  55.84 
 
 
309 aa  318  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  54.25 
 
 
310 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  53.9 
 
 
308 aa  309  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  49.02 
 
 
306 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  40.72 
 
 
315 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  41.18 
 
 
306 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  43.46 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  41.1 
 
 
319 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  41.29 
 
 
322 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  44.37 
 
 
312 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  40.97 
 
 
310 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  38.76 
 
 
322 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  40.97 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  40.78 
 
 
310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  42.48 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  40.63 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  39.61 
 
 
307 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  37.94 
 
 
315 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  37.46 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  37.62 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  36.33 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 
314 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  37.66 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  36.83 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  36.77 
 
 
311 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.18 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  39.79 
 
 
313 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
319 aa  152  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  36.89 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  37.01 
 
 
317 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  34.41 
 
 
326 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.86 
 
 
323 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  36.57 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  36.57 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  34.38 
 
 
323 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  36.36 
 
 
346 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 
332 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  35.64 
 
 
316 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.12 
 
 
303 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  35.2 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  35.41 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  35.05 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.56 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  34.75 
 
 
309 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  31.86 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  33.01 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  31.09 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  34.85 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  33.66 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  33.44 
 
 
338 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.17 
 
 
323 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
306 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  32.37 
 
 
344 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  33.44 
 
 
306 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  33.88 
 
 
303 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  36.33 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  33.84 
 
 
332 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  32.21 
 
 
298 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  31.31 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  32.26 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
300 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  29.41 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  29.84 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.67 
 
 
308 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.33 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 
315 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  33.01 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  34.92 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
326 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.82 
 
 
320 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  35.42 
 
 
284 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  28.2 
 
 
313 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  30.35 
 
 
317 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.28 
 
 
304 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.28 
 
 
304 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.63 
 
 
313 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.24 
 
 
307 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
302 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  31.58 
 
 
316 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  32.83 
 
 
317 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>