More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0108 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  77.27 
 
 		 308 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  74.68 
 
 		 308 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  73.38 
 
 		 308 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  63.73 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  63.4 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  62.75 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  61.44 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  60.46 
 
 		 306 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  59.8 
 
 		 306 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  54.25 
 
 		 306 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  54.58 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  54.22 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  54.22 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  47.71 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  38.89 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  41.83 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  42.9 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  38.11 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  43.55 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  44.37 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  37.18 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  36.66 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  40.2 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  37.18 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  40.07 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  36.33 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  39.05 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  39.09 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  39.1 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  38.06 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  36.83 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  37.1 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  33.87 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  36.57 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  36.04 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  37.18 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.44 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  34.18 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  35.5 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  33.76 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  35.81 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  33.64 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  32.38 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  32.6 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  37.1 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  32.58 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.19 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  35.2 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  36.66 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  34.09 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  33.97 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  34.2 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  34.69 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.86 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  32.47 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  32.8 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  32.9 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  38.08 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  32.28 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  30.89 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  31.05 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  33.54 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.59 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.19 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  38.46 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  31.05 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  31.05 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.32 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  38.31 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  31.05 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.39 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  35.74 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  35.74 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  35.74 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  35.74 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>