More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2994 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
302 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  99.34 
 
 
302 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  99.34 
 
 
302 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  95.02 
 
 
302 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  94.35 
 
 
302 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  94.35 
 
 
302 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  95.68 
 
 
302 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  79.73 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  79.73 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  79.73 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  79.73 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  79.73 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  79.73 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  79.73 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  80.07 
 
 
302 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  73.51 
 
 
308 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  75.34 
 
 
305 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  73.99 
 
 
305 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  52.17 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  52.84 
 
 
319 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  52.33 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  52.33 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  52.33 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  51.15 
 
 
308 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  52 
 
 
311 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  53.21 
 
 
284 aa  239  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  50.67 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  51.01 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  38.83 
 
 
322 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  35.95 
 
 
306 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.99 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  35.83 
 
 
314 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  35.06 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  35.48 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  38.26 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  33.12 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.29 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  32.41 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.94 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.66 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  34.95 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  34.77 
 
 
306 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
319 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  35.5 
 
 
308 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  34.3 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.36 
 
 
307 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
335 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 
306 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  31.6 
 
 
308 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  32.27 
 
 
321 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.57 
 
 
298 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
322 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  31.82 
 
 
308 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.03 
 
 
323 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.1 
 
 
311 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.98 
 
 
311 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  34.73 
 
 
308 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  37.55 
 
 
308 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.03 
 
 
307 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.96 
 
 
306 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  34.29 
 
 
312 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  37.09 
 
 
303 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
313 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  33.98 
 
 
312 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  32.78 
 
 
315 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  26.27 
 
 
336 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.97 
 
 
323 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  29.81 
 
 
323 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30.48 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 
326 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  33.59 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  32.68 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.45 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  32.55 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.64 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.41 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  29.86 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.36 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  32.64 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.11 
 
 
319 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  29.86 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.86 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  34.04 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.5 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.89 
 
 
319 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  31.75 
 
 
319 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.94 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  33.67 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  35.36 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  32.42 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  34.14 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  32 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.63 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>