More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2601 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  64.78 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  62.39 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  55.49 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  35.16 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  35.76 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  36.76 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.48 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  35.64 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  32.48 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.75 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  31.39 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  31.86 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 		 306 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  32.8 
 
 		 308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.6 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  32.91 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.5 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  35.66 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  32.59 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.82 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  35.69 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  29.21 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  32.05 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.83 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.66 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  32.09 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.89 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.76 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  34.07 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.62 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  33.98 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 315 aa  96.7  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  24.21 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.07 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  33.59 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  31.55 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  32.92 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.94 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  30.67 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  33.76 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  33.73 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  33.23 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  30.35 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  34.57 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 309 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.02 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.94 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  28.84 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.62 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  31.68 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  34.75 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  32.96 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  31.65 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  30.67 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  30 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.08 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  31.48 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  33.09 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  31.95 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.85 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  32.36 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  31.6 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.54 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  29.56 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  30.5 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  32.85 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.97 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  29.07 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>