More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3872 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  50.17 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  47.51 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  45.64 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  45.15 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  46.82 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  44.82 
 
 		 317 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  44.82 
 
 		 317 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  42.95 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  44.67 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  41.64 
 
 		 329 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  44.67 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  49.48 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  42.62 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  46.28 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  43.33 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  42.76 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  48.06 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  43.58 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  41.56 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  41.53 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  42.59 
 
 		 332 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  41.2 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  37.62 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  37.62 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  37.18 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  38.24 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  35.86 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  39.74 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  34.39 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  34.49 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  38.29 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  36.91 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  35.18 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  35.24 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  40.38 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.01 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  36.66 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  32.69 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  34.48 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.11 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  35.65 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  35.37 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  33.12 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  34.17 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  34.5 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  38.36 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  35.9 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.71 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  36.28 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  43.06 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  36.48 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  38.7 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  36.94 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  36.62 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  32.4 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  27.16 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  33.66 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.51 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  32.52 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.11 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  32.19 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.59 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.07 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  35.47 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.49 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  34.14 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  34.14 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  29.43 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  33.87 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.41 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  31.97 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.59 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  31.85 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.94 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  34.5 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.42 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  34.54 
 
 		 316 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.71 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.45 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>