More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3490 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  84.01 
 
 		 320 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  44.48 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  43.65 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  43.55 
 
 		 311 aa  222  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  41.88 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  43.46 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  42.31 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  41.53 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  39.68 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  43.27 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  40.97 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  38.94 
 
 		 329 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  39.74 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  41.51 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  41.99 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  40.26 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  42.07 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  40.51 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  41.77 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  42.02 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  36.25 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  38.02 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  31.63 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  37.89 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  40.37 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  40.66 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  38.19 
 
 		 306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  37.35 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  34.63 
 
 		 308 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  39.87 
 
 		 310 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  35.92 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  34.3 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  34.95 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  39.22 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  38.91 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  37.81 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  38.44 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  38.44 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  34.95 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  38.44 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  36.83 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  38.78 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  40.98 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  37.34 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  34.95 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  38.69 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  37.79 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  38.02 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.57 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  34.82 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.99 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.66 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  38.85 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  35.51 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.65 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.86 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  35.94 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.69 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.39 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  32.05 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.01 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  33.55 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  33.23 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  33.86 
 
 		 344 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  33.85 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  41.28 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.66 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.54 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.18 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  30.79 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  31.74 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.45 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.65 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.82 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.87 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  33.65 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  32.32 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.79 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.65 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>