More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3202 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  100 
 
 		 344 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  64.78 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  60.93 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  56.25 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  35.77 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.59 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  32.37 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  34.85 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.16 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.96 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.12 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  33.44 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  33.01 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  33.21 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.13 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.09 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.19 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.44 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  36 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  34.6 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.2 
 
 		 307 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  36.47 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  33.54 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.67 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  31.11 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.73 
 
 		 315 aa  106  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  36.19 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.46 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  35.21 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.32 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.72 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  33.64 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  25.94 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.18 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.09 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  28.21 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  34.57 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  30.65 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.85 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.73 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  31.48 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  32.19 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.62 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.25 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  27.88 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  30.86 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  29.96 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 		 316 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  33.46 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  30.28 
 
 		 306 aa  93.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  34.16 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  32.21 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.93 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.02 
 
 		 303 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  33.96 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.66 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.57 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.45 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.15 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  34.35 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.94 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  32.31 
 
 		 310 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.35 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  31.89 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.78 
 
 		 317 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  33.09 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25 
 
 		 315 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  31.8 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  29.59 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  31.82 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.88 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  32.2 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.63 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  29.28 
 
 		 311 aa  86.3  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  31.77 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.68 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>