More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2797 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  100 
 
 		 308 aa  599  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  66.23 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  63.4 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  63.73 
 
 		 306 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  63.07 
 
 		 306 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  62.01 
 
 		 308 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  55.56 
 
 		 306 aa  326  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  55.23 
 
 		 308 aa  324  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  54.58 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  54.9 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  53.92 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  53.59 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  53.27 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  53.27 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  54.58 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  43.46 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  41.5 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  36.48 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  43.71 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  40.65 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  43.09 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  44.69 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  43.46 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  41.5 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  43.14 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  37.94 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  37.78 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  38.56 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  40 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  38.14 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.37 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  34.73 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  39.74 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  39.16 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  38.34 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  39.68 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  38.06 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  36.28 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  37.38 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  36.45 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.12 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  36.57 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  38.56 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  38.03 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  32.6 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  38.39 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  34.31 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  39.42 
 
 		 300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  36.05 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  36.76 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  39.44 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  34.13 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  35.87 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  35.27 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  36.48 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  36.57 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  36.01 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  33.55 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  35.95 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.78 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  35.13 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.95 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  35.83 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  36.04 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  34.6 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  34.01 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.71 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  36.34 
 
 		 338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  36.19 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  34.14 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  34.53 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  33.63 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  35.28 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  29.7 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  34.54 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.21 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  33.88 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  32.79 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.58 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  29.04 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.1 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>