More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3592 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  100 
 
 
311 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  81.19 
 
 
307 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  68.98 
 
 
307 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  66.67 
 
 
311 aa  414  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  63.37 
 
 
309 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  60.4 
 
 
306 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  59.41 
 
 
304 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  59.41 
 
 
304 aa  343  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  59.74 
 
 
298 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  53.27 
 
 
323 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  52.15 
 
 
308 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  51.47 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  44.12 
 
 
319 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  44.12 
 
 
319 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  44.12 
 
 
319 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  43.79 
 
 
319 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  43.79 
 
 
319 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 
322 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  38.76 
 
 
317 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  32.4 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  32.46 
 
 
323 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  36.97 
 
 
326 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.11 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  33.11 
 
 
313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  30.48 
 
 
315 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  32.46 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  32.46 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  32.46 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 
319 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  30.16 
 
 
315 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 
319 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  34.86 
 
 
322 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  39.87 
 
 
323 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  31.25 
 
 
321 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  31.09 
 
 
336 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  35.69 
 
 
319 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.48 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 
319 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 
319 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.43 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  38.46 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  38.46 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  34.84 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 
315 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  36.05 
 
 
319 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 
315 aa  142  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  31.63 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  37.13 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  37.5 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 
323 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  31.17 
 
 
355 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  36.5 
 
 
328 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 
319 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  32.48 
 
 
337 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  31.23 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  35.91 
 
 
338 aa  135  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  35.6 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  36.23 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  30.49 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  34.8 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  30.77 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  32.49 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 
319 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  32.8 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.27 
 
 
320 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  33.12 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  32.12 
 
 
317 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 
324 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  34.39 
 
 
331 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.47 
 
 
306 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  33.68 
 
 
325 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  27.97 
 
 
314 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  33.33 
 
 
306 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  33.94 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  33.71 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  32.26 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  33.78 
 
 
329 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  31.72 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  32.61 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.97 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.53 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  33.22 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  27.87 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  34.14 
 
 
329 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.14 
 
 
329 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.78 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.67 
 
 
329 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  32.42 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  27.13 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  31.09 
 
 
293 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 
312 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.95 
 
 
303 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  31.13 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>