More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2120 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  613  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  43.44 
 
 
321 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  44.22 
 
 
326 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  43.55 
 
 
320 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  44.34 
 
 
306 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  45.1 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  42.44 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  44.87 
 
 
312 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  36.33 
 
 
315 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  41.46 
 
 
317 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
320 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  43.91 
 
 
313 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  39.48 
 
 
308 aa  205  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  43.23 
 
 
319 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  39.68 
 
 
308 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  39.24 
 
 
315 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  41.1 
 
 
309 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 
319 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  41.23 
 
 
306 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  38.14 
 
 
334 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  40.19 
 
 
321 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  38.19 
 
 
308 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  38.06 
 
 
308 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  38.83 
 
 
308 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  40.26 
 
 
312 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  44.01 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  38.51 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  38.59 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  38.59 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  35.58 
 
 
312 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.58 
 
 
312 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  38.26 
 
 
310 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  39.81 
 
 
322 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  36.54 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  41.12 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  37.14 
 
 
323 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  39.09 
 
 
316 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  36.01 
 
 
329 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  40.96 
 
 
328 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  36.57 
 
 
306 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  39.74 
 
 
306 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  37.93 
 
 
308 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  37.25 
 
 
311 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 
306 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  38.34 
 
 
323 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  38.96 
 
 
303 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  37.86 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  37.06 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 
306 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  37.87 
 
 
309 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  37.01 
 
 
346 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  35.52 
 
 
338 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  36.54 
 
 
309 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 
317 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  36.57 
 
 
310 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  37.34 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 
309 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  36.51 
 
 
316 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 
333 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  35.06 
 
 
303 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  36.45 
 
 
306 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  40.07 
 
 
315 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  37.78 
 
 
335 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  31.17 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  35.14 
 
 
326 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  31.17 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  35.95 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  38.28 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  31.15 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  30.64 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  30.64 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  30.64 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  37.1 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
322 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.31 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.14 
 
 
310 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  33.64 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  37.7 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.78 
 
 
323 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  32.6 
 
 
313 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.78 
 
 
323 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  33.01 
 
 
319 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  34.08 
 
 
316 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  30.54 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
319 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.15 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  31.86 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.21 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  33.65 
 
 
322 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.79 
 
 
304 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>