More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5753 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  100 
 
 		 326 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  44.22 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  43.65 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  43.65 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  42.72 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  41.93 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  40.4 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  40 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  39.55 
 
 		 313 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  34.1 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  40.59 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  37.38 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  39.93 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  38.66 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  37.42 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  37.92 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.56 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  40.39 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  39.55 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  38.11 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  36.89 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  41.23 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  37.29 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  37.05 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  37.26 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  37.26 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  38.8 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  36.42 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  35.39 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  34.74 
 
 		 308 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  39.24 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  36.01 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  38.11 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  37.58 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.98 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  37.22 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.7 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.04 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.03 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.44 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  38.66 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  33.01 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  34.18 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  34.41 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.28 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  37.29 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  34.98 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  34.95 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.66 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.18 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.58 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  35.86 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  34.31 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  33.98 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.07 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  33.44 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  34.09 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  32.14 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.65 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  32.8 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.92 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.86 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.81 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  32.4 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.85 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.96 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  30.17 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.26 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.95 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  29.48 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  26.58 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  29.25 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  26.58 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.55 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  31.04 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  32.03 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>