More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0600 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  100 
 
 		 323 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  65.16 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  63.93 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  53.95 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  53.95 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  55.78 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  54.72 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  53.27 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  52.54 
 
 		 307 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  51.68 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  50.83 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  50.83 
 
 		 304 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  43.14 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  43.46 
 
 		 319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  42.81 
 
 		 319 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  42.81 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  42.81 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  33.54 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  32.8 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  32.8 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  32.8 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  34.39 
 
 		 319 aa  182  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.23 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  33.23 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.92 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  32.2 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  34.38 
 
 		 336 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.53 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.65 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  29.65 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  33.02 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  36.3 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.97 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 317 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  32.34 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  36.31 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  35.48 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  35.29 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  34.49 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  33.76 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  32.91 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  34.4 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.33 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  32.39 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.18 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  35.02 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  29.08 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  34.64 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  31.86 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.64 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.13 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  32.76 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  33.22 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  35.08 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  33.45 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  29.33 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  32.91 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  29.53 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  34.45 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.33 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  30.41 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.95 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  31.92 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.03 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.93 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  33.59 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.52 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  30 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  30.14 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  32.8 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.43 
 
 		 645 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  31.49 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  31.83 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  33.85 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  29.59 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  30.48 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  32.88 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  29.73 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>