More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2704 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  100 
 
 
317 aa  646    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  47.39 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  46.5 
 
 
329 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  43.83 
 
 
320 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  46.5 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  45.66 
 
 
330 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.62 
 
 
329 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  44.62 
 
 
329 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  42.86 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  44.3 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.3 
 
 
329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  45.31 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  45.31 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  45.31 
 
 
330 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  43.28 
 
 
312 aa  238  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  45.54 
 
 
328 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  43.18 
 
 
327 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.62 
 
 
329 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  44.59 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  41.83 
 
 
314 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  43.23 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  44.05 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  42.81 
 
 
345 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  43.73 
 
 
330 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  43.34 
 
 
306 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  43.99 
 
 
324 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 
316 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 
316 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  41.83 
 
 
315 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  43.79 
 
 
316 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  41.69 
 
 
317 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  42.62 
 
 
316 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  41.97 
 
 
314 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  40.69 
 
 
329 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  43.42 
 
 
320 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  35.81 
 
 
313 aa  219  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 
301 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  43.46 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  41.14 
 
 
301 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  40.91 
 
 
323 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 
316 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  36.77 
 
 
319 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  43.32 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  40.72 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  38.91 
 
 
344 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 
322 aa  193  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.69 
 
 
320 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  32.08 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  38.28 
 
 
329 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40 
 
 
321 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  42.75 
 
 
320 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  35.92 
 
 
311 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  38.06 
 
 
326 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.1 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.04 
 
 
270 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  41.67 
 
 
327 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.48 
 
 
291 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  43.12 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  38.73 
 
 
308 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  38.73 
 
 
308 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  38.1 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  34.84 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  36.79 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  35.83 
 
 
316 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.15 
 
 
308 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  39.93 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.39 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  37.66 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  31.92 
 
 
338 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 
308 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  36.04 
 
 
308 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  36.04 
 
 
308 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  39.16 
 
 
320 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  36.94 
 
 
319 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  35.83 
 
 
316 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 
312 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  36.04 
 
 
308 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  31.23 
 
 
332 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  31.23 
 
 
332 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  31.23 
 
 
332 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  36.63 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  30.9 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  37.73 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  37.73 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  31.37 
 
 
338 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  31.68 
 
 
332 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  33.95 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  36.69 
 
 
342 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  37.46 
 
 
308 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  37.46 
 
 
308 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  37.46 
 
 
308 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.87 
 
 
311 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  34.59 
 
 
312 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  37.13 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.7 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  37.13 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  37.13 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>