More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3387 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 335 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  72.67 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  52.04 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  52.96 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  45.54 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  45.62 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  41.98 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  41.74 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  41.43 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  37.81 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  37.81 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  40.31 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  38.32 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  37.19 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  39.88 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  37.19 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  37.5 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.98 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  35.92 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  34.27 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  34.27 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  32.82 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  34.95 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  36.83 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  35.26 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  38.19 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.64 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  33.64 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  33.12 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  33.12 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  33.12 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  35.08 
 
 		 323 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  32.69 
 
 		 308 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.83 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.48 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  33.55 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  34.46 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  33.54 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  33.23 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.69 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  31.87 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  33.95 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  33.54 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  33.01 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  35.37 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.01 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  33.12 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  34.3 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  32.79 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  32.51 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  32.08 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  34.08 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.83 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  30.91 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  30.5 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30.84 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  34.25 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  31.55 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  29.77 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  31.95 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  29.07 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  29.65 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  34.01 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  31.5 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  31.4 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.06 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  33.44 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  31.41 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  30.58 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  32.32 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.33 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  26.84 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  33.87 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  31.04 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  29 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  30 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  29.86 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  31.39 
 
 		 306 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  31.02 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.34 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>