More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2884 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  99.01 
 
 		 302 aa  590  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  93.05 
 
 		 302 aa  534  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  94.35 
 
 		 302 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  93.69 
 
 		 302 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  93.69 
 
 		 302 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  91.39 
 
 		 302 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  80.07 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  80.07 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  80.07 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  80.07 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  80.07 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  80.07 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  80.07 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  81.06 
 
 		 302 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  74.17 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  74.32 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  72.97 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  51.17 
 
 		 307 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  52.33 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  52.84 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  52 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  52 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  52.33 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  51.53 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  52.86 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  50.67 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  50.34 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  37.54 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  29.58 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.79 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.3 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  34.74 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  32.07 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.66 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  33.33 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  32.29 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  36.16 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  33.44 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  38.08 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.07 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  37.5 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.98 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.68 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.33 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.36 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.17 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  36.98 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.1 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.7 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.59 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  31.49 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  26.18 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.59 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.52 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  34.52 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.16 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  32.08 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  32.25 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  32.7 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.1 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  30.62 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  32.11 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.36 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  31.94 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  32.82 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  33.07 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.86 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  28.26 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.94 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.22 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  33.55 
 
 		 346 aa  92.8  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 329 aa  92.8  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.13 
 
 		 319 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.95 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.58 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.6 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.22 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  34.32 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.22 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.05 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  35.36 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>