More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2902 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  100 
 
 		 345 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  74.19 
 
 		 314 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  73.29 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  73.62 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  71.66 
 
 		 316 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  71.66 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  71.01 
 
 		 316 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  71.66 
 
 		 316 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  65.26 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  60.59 
 
 		 327 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  62.62 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  63.73 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  63.07 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  59.68 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  63.73 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  62.75 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  60.43 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  62.09 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  62.01 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  62.34 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  61.44 
 
 		 329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  60.13 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  60.13 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  60.13 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  60.13 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  58.75 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  57.33 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  57.52 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  55.23 
 
 		 312 aa  341  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  55.05 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  55.19 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  56.21 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  55.77 
 
 		 324 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  49.67 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  40.79 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.55 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.53 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.56 
 
 		 270 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  42.81 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  40.32 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  40.39 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  37.46 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  35.92 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  37.98 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  36.88 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  37.29 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  41.53 
 
 		 321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  35.88 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  34.21 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  38.14 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  35.69 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  36.25 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  35.06 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  35.88 
 
 		 301 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  36.79 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.91 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  34.9 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  34.41 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.01 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  35.56 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  36.66 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.14 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.88 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  30.22 
 
 		 628 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  35.56 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.05 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  32.42 
 
 		 645 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  29.6 
 
 		 628 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.74 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.32 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  35.59 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.55 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  34.27 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  35.42 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.03 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  33.94 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.58 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  34.43 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.21 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  34.52 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.44 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.81 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  28.22 
 
 		 634 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  33.53 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.91 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.97 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  30.94 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  30.94 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  31.71 
 
 		 642 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  30.98 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>