More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2146 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  100 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  78.86 
 
 		 319 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  79.25 
 
 		 319 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  78.93 
 
 		 319 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  77.36 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  77.36 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  77.36 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  76.73 
 
 		 318 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  74.84 
 
 		 318 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  74.53 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  74.53 
 
 		 318 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  74.53 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  74.53 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  74.53 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  73.9 
 
 		 318 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  73.8 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  55.45 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  42.41 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  42.49 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  42.59 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  45.66 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  43.49 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  47 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  38.46 
 
 		 310 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  44.09 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  44.79 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  41.8 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  39.35 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  36.07 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  42.47 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  42.17 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  41.99 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  41.67 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  38.01 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  34.19 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  33.02 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  32.85 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.95 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.82 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.09 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.48 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  32.85 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  32.85 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.82 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.82 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.79 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  29.71 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.82 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.72 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.53 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.3 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.82 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.85 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.24 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.36 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.3 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.83 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.64 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.42 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.87 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.55 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.23 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.78 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.03 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.87 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  31.62 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  33.33 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.1 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  32.34 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  31.73 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  24.84 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  31.35 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.85 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  33.58 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  33.58 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  33.58 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  33.58 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.64 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.5 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.13 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.53 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 327 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  29.02 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  30.53 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  30.53 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>