More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0388 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  100 
 
 
299 aa  596  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  48.34 
 
 
317 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  46.71 
 
 
314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  41.31 
 
 
311 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  41.89 
 
 
320 aa  228  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  39.02 
 
 
322 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  41.97 
 
 
310 aa  225  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  41.12 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  38.28 
 
 
313 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  36.6 
 
 
318 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  36.57 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  36.27 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  36.27 
 
 
318 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  37.79 
 
 
318 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  36.07 
 
 
318 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 
320 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  38.31 
 
 
349 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  36.77 
 
 
323 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  37.83 
 
 
326 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 
313 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  38.03 
 
 
325 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  37.38 
 
 
325 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 
313 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  39.73 
 
 
315 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  36.7 
 
 
318 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  36.7 
 
 
318 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  36.7 
 
 
318 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  36.7 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  36.7 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  36.7 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  36.7 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  32.81 
 
 
271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 
301 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
301 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  31.48 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  29.97 
 
 
307 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  29.35 
 
 
312 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  32.05 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.58 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  28.43 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.11 
 
 
322 aa  113  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  30.25 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  29.81 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  28.62 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  28.95 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  26.62 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.97 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.43 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  27.97 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  27.97 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 
319 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.23 
 
 
330 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.22 
 
 
308 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.22 
 
 
308 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  27.33 
 
 
345 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.69 
 
 
329 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
308 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.65 
 
 
329 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
330 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  27.42 
 
 
315 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 
328 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 
316 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  27.06 
 
 
312 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.14 
 
 
320 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  28.43 
 
 
327 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  26.49 
 
 
329 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 
308 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.57 
 
 
323 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  26.17 
 
 
323 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.27 
 
 
304 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  29.21 
 
 
319 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  27.57 
 
 
308 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 
326 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  27.19 
 
 
628 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  25.95 
 
 
319 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.27 
 
 
304 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  28.15 
 
 
308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  28.15 
 
 
308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 
322 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  28.79 
 
 
329 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 
340 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  26.03 
 
 
320 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.21 
 
 
306 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  30.26 
 
 
314 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.94 
 
 
321 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
316 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 
329 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.29 
 
 
322 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  25.64 
 
 
355 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  27.27 
 
 
314 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>