More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5091 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  100 
 
 
309 aa  624  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  59.02 
 
 
316 aa  324  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  58.75 
 
 
308 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  57.19 
 
 
311 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  58.75 
 
 
308 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  57.62 
 
 
311 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  59.74 
 
 
308 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  59.74 
 
 
308 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  59.41 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  58.84 
 
 
309 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  61.22 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  59.74 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  59.41 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  56.15 
 
 
308 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  56.15 
 
 
308 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  59.08 
 
 
308 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  57.62 
 
 
312 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  55.02 
 
 
308 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  55.02 
 
 
308 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  59.08 
 
 
308 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  59.08 
 
 
308 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  59.08 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  58.75 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  58.75 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  58.75 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  58.75 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  46.53 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  38.17 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  38.24 
 
 
312 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  35.43 
 
 
327 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  34.67 
 
 
327 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 
301 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.33 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.75 
 
 
321 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  31.65 
 
 
320 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.28 
 
 
313 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  37.74 
 
 
301 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  34.98 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  32.67 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.33 
 
 
331 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  34.52 
 
 
329 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  33.65 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  34.64 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  34.54 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.73 
 
 
329 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  34.73 
 
 
329 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 
328 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  34.41 
 
 
329 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  33.65 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.91 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.41 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  34.75 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.41 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33.23 
 
 
329 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.9 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.9 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.48 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.23 
 
 
308 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  31.51 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  36.18 
 
 
344 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  34.19 
 
 
324 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.48 
 
 
304 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  35.02 
 
 
320 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  32.15 
 
 
340 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.35 
 
 
345 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.72 
 
 
311 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
305 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 
322 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  35.69 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
317 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 
310 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  27.74 
 
 
314 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  28.23 
 
 
310 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
325 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.25 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.08 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  30.89 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.63 
 
 
309 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  31.29 
 
 
314 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 
320 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  30.54 
 
 
313 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.24 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.1 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.71 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.71 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.71 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.69 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.01 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.66 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  29.86 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.32 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>