More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0275 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  616  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  41.64 
 
 
308 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  39.87 
 
 
308 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  38.18 
 
 
301 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.77 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  36.72 
 
 
312 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  38.82 
 
 
316 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  38.28 
 
 
301 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  38.54 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  40.07 
 
 
311 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  38.87 
 
 
308 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 
308 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 
308 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  40.67 
 
 
311 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.69 
 
 
322 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.43 
 
 
298 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  33.11 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  39.53 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  39.21 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.29 
 
 
309 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 
308 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  38.49 
 
 
312 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 
326 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  38.82 
 
 
316 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  40.66 
 
 
308 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  37.82 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  37.82 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  34.22 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  38.21 
 
 
308 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  38.21 
 
 
308 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  34.85 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  34.53 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.53 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  37.87 
 
 
309 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  41.31 
 
 
308 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  34.85 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  34.53 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  41.31 
 
 
308 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.53 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.5 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.12 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.41 
 
 
307 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.53 
 
 
309 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  36.59 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.53 
 
 
309 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  33.77 
 
 
315 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 
325 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  40.98 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  34.44 
 
 
305 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.66 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  40.98 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  35.99 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  40.98 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  40.98 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  40.98 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.26 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  33.54 
 
 
310 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.48 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.11 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.48 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  34.48 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.3 
 
 
309 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.43 
 
 
305 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.43 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  33.77 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  34.64 
 
 
306 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
322 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.76 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  34.59 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  32.43 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  35.97 
 
 
306 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  32.29 
 
 
310 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  35.59 
 
 
329 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.69 
 
 
329 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  35.69 
 
 
329 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.35 
 
 
329 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  31.11 
 
 
307 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  34.19 
 
 
312 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  31.39 
 
 
313 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.29 
 
 
313 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.33 
 
 
329 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.33 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  34.27 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 
320 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  29.41 
 
 
338 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.93 
 
 
329 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1005  PfkB domain protein  35.25 
 
 
320 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  32.88 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.86 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  31.72 
 
 
314 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 
319 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33 
 
 
329 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.19 
 
 
330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.35 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  32.19 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  32.19 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>