More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4075 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  100 
 
 		 310 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  86.45 
 
 		 310 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  83.55 
 
 		 310 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  82.9 
 
 		 310 aa  554  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  77.35 
 
 		 310 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  75.24 
 
 		 309 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  75.65 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.96 
 
 		 314 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  75.96 
 
 		 314 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.96 
 
 		 314 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.65 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.65 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  75.65 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  75.32 
 
 		 309 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.32 
 
 		 309 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  75.32 
 
 		 309 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.32 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75 
 
 		 309 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  52.96 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.61 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  51.61 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  52.29 
 
 		 311 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.98 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  47.56 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  47.57 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  46.77 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.44 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.82 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  43.97 
 
 		 312 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  47.35 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.38 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.05 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.13 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  44.59 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.51 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  39.94 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  47.54 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  41.06 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.97 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  40.92 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  36.75 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.26 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  40.54 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.08 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  39.86 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  33.22 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.97 
 
 		 312 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.69 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  37.13 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  35.2 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.46 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  40.33 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  39.53 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.35 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.51 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  38.77 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.29 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.56 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  33.21 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.58 
 
 		 250 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  30.23 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  30.23 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  41.06 
 
 		 153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  28.88 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.03 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  31.34 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  31.9 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  31.9 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.62 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  29.29 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  29.39 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.67 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.88 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  32.28 
 
 		 323 aa  95.5  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  31.77 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  30.47 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.82 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  32.16 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  28.83 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  28.83 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.47 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  28.83 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>