More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3864 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  48.32 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.18 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  47.85 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  46.1 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  49.27 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  44.93 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.26 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  42.56 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  47.8 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  49.32 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  45.58 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  47.17 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  40.47 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.66 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.8 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.47 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  38.67 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.13 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.73 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.67 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.48 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.67 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.67 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  34.1 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  38.87 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  38.54 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.54 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  38.8 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  39.33 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.33 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.67 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  36.33 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  36.33 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.33 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.33 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  35.64 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.33 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  37.46 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.32 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  37.33 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.75 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.75 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.39 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.26 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.82 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.26 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  33.22 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  32.9 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  40.21 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  34 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  35.66 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.86 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  31.89 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  35.31 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.93 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.93 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  35.53 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.08 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.95 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  33.09 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.58 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.01 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  33.82 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  33.82 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  33.82 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  29.87 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  31.72 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  33.76 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  33.82 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  33.82 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  33.82 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.94 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  33.82 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  32.78 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.76 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.95 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.55 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.89 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.44 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.44 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.9 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  32.44 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.25 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  31.21 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>