98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01471 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  50.69 
 
 		 313 aa  156  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  43.62 
 
 		 307 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  47.92 
 
 		 309 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  40.54 
 
 		 315 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  44.83 
 
 		 318 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.79 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  40.94 
 
 		 310 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  41.06 
 
 		 310 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.43 
 
 		 299 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.4 
 
 		 314 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  40.4 
 
 		 314 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.4 
 
 		 314 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  43.05 
 
 		 310 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.91 
 
 		 322 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  40.91 
 
 		 258 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  41.72 
 
 		 310 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  40.4 
 
 		 310 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.67 
 
 		 309 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  38.67 
 
 		 309 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  38.67 
 
 		 309 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.67 
 
 		 309 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  38.67 
 
 		 309 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  38.67 
 
 		 309 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.67 
 
 		 309 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.31 
 
 		 309 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.91 
 
 		 309 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  43.8 
 
 		 311 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38 
 
 		 309 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  43.07 
 
 		 312 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.18 
 
 		 307 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  41.83 
 
 		 307 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.01 
 
 		 311 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  43.88 
 
 		 306 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.28 
 
 		 304 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 312 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  39.72 
 
 		 302 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  43.8 
 
 		 306 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  43.8 
 
 		 311 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.13 
 
 		 309 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  41.48 
 
 		 310 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  39.31 
 
 		 302 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.81 
 
 		 312 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  39.01 
 
 		 314 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.28 
 
 		 304 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  36.67 
 
 		 326 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  35.29 
 
 		 325 aa  87.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.68 
 
 		 298 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.06 
 
 		 309 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.67 
 
 		 295 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.14 
 
 		 331 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.46 
 
 		 290 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 305 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  39.71 
 
 		 305 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.96 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.24 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  35.57 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.43 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  39.42 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  32.89 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.82 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.58 
 
 		 250 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.81 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  30.83 
 
 		 308 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  27.07 
 
 		 312 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 		 308 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.08 
 
 		 308 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  28.36 
 
 		 316 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 		 308 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  28.95 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  28.57 
 
 		 308 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  28.57 
 
 		 308 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 		 301 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  28.36 
 
 		 316 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  28.95 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  29.01 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.88 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  27.41 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  27.41 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 341 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  30.65 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  27.82 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 308 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 323 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  25.76 
 
 		 309 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl514  fructokinase  24.39 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  22.62 
 
 		 329 aa  40.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>