More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2368 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  87.83 
 
 
305 aa  534  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  87.83 
 
 
305 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  45.95 
 
 
306 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.56 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.39 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  45.76 
 
 
306 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  43.88 
 
 
310 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42 
 
 
309 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.81 
 
 
331 aa  218  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  44.41 
 
 
299 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  41.39 
 
 
310 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  41.39 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.39 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.39 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  41.06 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  41.06 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  42.72 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  41.39 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.39 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.14 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.39 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  42.47 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.06 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  40.73 
 
 
309 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  40.73 
 
 
309 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  45.67 
 
 
302 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  41.86 
 
 
310 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  42.66 
 
 
325 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  46.39 
 
 
302 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  43.81 
 
 
305 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  40.68 
 
 
307 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  44.33 
 
 
304 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  46.64 
 
 
297 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.31 
 
 
314 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.31 
 
 
314 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  41.31 
 
 
314 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.28 
 
 
307 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.12 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.2 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  39.8 
 
 
325 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.36 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.93 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  40.67 
 
 
326 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.14 
 
 
325 aa  185  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  40.6 
 
 
311 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  37.05 
 
 
315 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.3 
 
 
322 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.24 
 
 
290 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.59 
 
 
318 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.54 
 
 
309 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 
313 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  38.61 
 
 
314 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  35 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.56 
 
 
250 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  32.88 
 
 
318 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  36.21 
 
 
311 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.9 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  41 
 
 
311 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  37.65 
 
 
258 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33 
 
 
312 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  34.09 
 
 
309 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.79 
 
 
308 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  32.8 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  32.8 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  32.39 
 
 
309 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  33.11 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.08 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  32.89 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  32.89 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.76 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.76 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.76 
 
 
308 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.86 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  32.2 
 
 
308 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  30.1 
 
 
311 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  32.88 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  32.88 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  32.54 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.09 
 
 
313 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  32.54 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  32.54 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  32.54 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  29.73 
 
 
311 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  32.54 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 
312 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  31.8 
 
 
316 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 
319 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.47 
 
 
327 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  28.73 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  28.93 
 
 
306 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  29.19 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01490  putative ketodeoxygluconokinase  34.59 
 
 
172 aa  89.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  28.42 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  27.96 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>