More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2574 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  48.82 
 
 
304 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  57.63 
 
 
302 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.18 
 
 
295 aa  262  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  50.17 
 
 
310 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  49.49 
 
 
306 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  49.66 
 
 
306 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  54.76 
 
 
302 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  46.1 
 
 
305 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  45.21 
 
 
325 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.02 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 
305 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.33 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  43.39 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.47 
 
 
307 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  41.47 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  56 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.81 
 
 
311 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  37.71 
 
 
307 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  38.49 
 
 
312 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  40.47 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.02 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.67 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  47.78 
 
 
297 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 
326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.33 
 
 
331 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.09 
 
 
322 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.58 
 
 
318 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38 
 
 
309 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.21 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  34.33 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.22 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  39.8 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  39.8 
 
 
311 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  39.2 
 
 
311 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.55 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  35.35 
 
 
310 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  35.22 
 
 
309 aa  165  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.22 
 
 
309 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  35.22 
 
 
309 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.22 
 
 
309 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.2 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  34.88 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  34.88 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.88 
 
 
309 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  35.76 
 
 
310 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.22 
 
 
309 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  35.14 
 
 
318 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  35.1 
 
 
310 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.55 
 
 
309 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.65 
 
 
314 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.65 
 
 
314 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  34.65 
 
 
314 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  36.03 
 
 
310 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  34.78 
 
 
315 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.59 
 
 
325 aa  155  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 
310 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 
311 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  39.26 
 
 
258 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.46 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  35.16 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.86 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  34.11 
 
 
312 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.28 
 
 
306 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  46.43 
 
 
153 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  34.3 
 
 
316 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 
316 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.88 
 
 
324 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33 
 
 
329 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.33 
 
 
329 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
320 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.25 
 
 
345 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.3 
 
 
317 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 
301 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.33 
 
 
329 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  32.33 
 
 
329 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  32 
 
 
329 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.37 
 
 
316 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 
308 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  31.21 
 
 
330 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  30.87 
 
 
329 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.55 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  32.09 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 
328 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 
340 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  29.97 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  32.24 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.5 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.96 
 
 
327 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  34.06 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  30.55 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  30.54 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  28.96 
 
 
327 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.91 
 
 
319 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>