More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2141 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  98 
 
 		 250 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  83.72 
 
 		 302 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  55.07 
 
 		 304 aa  311  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  57.63 
 
 		 299 aa  291  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  51.85 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  52.19 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  52.9 
 
 		 305 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  47.8 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  54.76 
 
 		 304 aa  255  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  48.47 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  46.02 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  46.71 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  43.77 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.02 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  43.48 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.77 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.81 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.33 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.67 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.8 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.27 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  38.74 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.77 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  44.15 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.36 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  38.36 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.36 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  39.27 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  39.02 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  39.27 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  39.02 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.02 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.02 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  51.31 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.02 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.02 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  43.14 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.02 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  39.86 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  43.51 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  39.27 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  38.61 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.6 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.41 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  38.87 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  36.95 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.03 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  34.58 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.61 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.63 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  41.58 
 
 		 311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.93 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  32.11 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.27 
 
 		 290 aa  162  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  41.81 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  39.53 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  34.3 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  37.87 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  35.84 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  35.71 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  34.44 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  35.86 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.75 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  33.45 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.9 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.82 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.33 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  32.14 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.44 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.2 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  35 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.2 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  33.99 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.6 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.6 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.57 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  34.44 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  33.99 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  34.43 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  32 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.09 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  35.16 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  33.88 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  34.07 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  32.32 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  35.16 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  35.16 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  38.16 
 
 		 153 aa  99  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  35.53 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  35.53 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  35.53 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>