More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3085 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  76.08 
 
 		 307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.75 
 
 		 307 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  52.51 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.8 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  51.8 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  52.15 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.15 
 
 		 309 aa  298  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  51.15 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  52.29 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  51.32 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.15 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.15 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  51.15 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  51.15 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  51.15 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.15 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  50.66 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.15 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  48.86 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  48.86 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  48.86 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  53.16 
 
 		 312 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  53.67 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  45.6 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.24 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  45.1 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.81 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  51.32 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  43.38 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.43 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.67 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.63 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.25 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.02 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.05 
 
 		 309 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  38.98 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.47 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  39.8 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  41.14 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.94 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  35.57 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  41.47 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.5 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.73 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.03 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  42.81 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.81 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  36 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.53 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  41.42 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  38.82 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  40.74 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  44.65 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  31.44 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  39.6 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.41 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.13 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  33.94 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.11 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  36.4 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.57 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.97 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  35.25 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.81 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  34.53 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.43 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.98 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.43 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.43 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  41.01 
 
 		 153 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.56 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  30.85 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.53 
 
 		 322 aa  95.5  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  29.21 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01490  putative ketodeoxygluconokinase  34.87 
 
 		 172 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  31.85 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  30.63 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  29.6 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  30.82 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  31.18 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  30.82 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  31.33 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  31.33 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  31.33 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  31.33 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.62 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  30.49 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  28.76 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  28.76 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.18 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  30.74 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  29.87 
 
 		 312 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>