More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1665 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  78.9 
 
 		 311 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  78.57 
 
 		 312 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  52.79 
 
 		 307 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.48 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  50.5 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.32 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  57.14 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  45.31 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.13 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  46.58 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  45.63 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  45.63 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.48 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  45.34 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.34 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.34 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  44.01 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  44.01 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.01 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.01 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  44.01 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.01 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  44.01 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.01 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  45.28 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.76 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  46.73 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.61 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.38 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.91 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  41.75 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.94 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.48 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  44.62 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.98 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.78 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.09 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  36.54 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  44.05 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.91 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  35.88 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  41.94 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  42 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.57 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.64 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.67 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  41.45 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  41.33 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  40.85 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  36.91 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  39.13 
 
 		 258 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.94 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.07 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  42.53 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  38.94 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  40.8 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.79 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  40.4 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.54 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.46 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  31.5 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.5 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.32 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  32.85 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.33 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.95 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  36.56 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  30.92 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  43.8 
 
 		 153 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.41 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.19 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  31.87 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  32.31 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  30.71 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.26 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.26 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.84 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  30.04 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  30.04 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.19 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.81 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.19 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.82 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  35.18 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.23 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>