More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6298 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  99.03 
 
 
308 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  96.1 
 
 
308 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  94.48 
 
 
308 aa  540  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  93.51 
 
 
308 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  89.61 
 
 
308 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  78.55 
 
 
316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  80.52 
 
 
308 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  80.39 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  78.41 
 
 
316 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  80.39 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  80.07 
 
 
308 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  79.74 
 
 
308 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  79.74 
 
 
308 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  79.74 
 
 
308 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  76.32 
 
 
312 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  79.74 
 
 
308 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  68.32 
 
 
311 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  69.73 
 
 
309 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  68.35 
 
 
308 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  67.11 
 
 
311 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  68.35 
 
 
308 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  59.74 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  53.29 
 
 
308 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  53.29 
 
 
308 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  51.03 
 
 
308 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  36.04 
 
 
317 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  38.87 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.83 
 
 
313 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  34.81 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  34.81 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 
330 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  34.52 
 
 
329 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 
328 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.35 
 
 
312 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  35.27 
 
 
329 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.01 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  31.29 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  34.19 
 
 
330 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  37.59 
 
 
301 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.39 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  34.44 
 
 
313 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
330 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33.23 
 
 
329 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  33.44 
 
 
327 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  32.2 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  34.42 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.92 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.08 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  36.52 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.42 
 
 
329 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  34.42 
 
 
329 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  34.1 
 
 
316 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.91 
 
 
323 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.14 
 
 
320 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  35.42 
 
 
316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  29.97 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.09 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.07 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.88 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.42 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.6 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  33.12 
 
 
327 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.85 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  31.92 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  33.01 
 
 
339 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  32.24 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33.78 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.9 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.27 
 
 
313 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  30.52 
 
 
319 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.27 
 
 
313 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.27 
 
 
313 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.32 
 
 
331 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.34 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  33.56 
 
 
318 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 
322 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  32.14 
 
 
306 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.14 
 
 
308 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  29.55 
 
 
320 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  33.45 
 
 
305 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 
320 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  32.76 
 
 
305 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  32.13 
 
 
347 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  30.36 
 
 
317 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 
325 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
315 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  32.26 
 
 
317 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  29.39 
 
 
314 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.11 
 
 
305 aa  122  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  33.82 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 
312 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>