More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1806 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  100 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  100 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  100 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  100 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  99.35 
 
 
308 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  99.35 
 
 
308 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  98.7 
 
 
308 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  95.75 
 
 
308 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  80.39 
 
 
308 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  80.39 
 
 
308 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  79.4 
 
 
316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  80.07 
 
 
308 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  79.74 
 
 
308 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  79.74 
 
 
308 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  79.08 
 
 
308 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  78.76 
 
 
308 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  80.4 
 
 
316 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  79.02 
 
 
312 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  69.26 
 
 
311 aa  384  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  66.55 
 
 
311 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  65.12 
 
 
308 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  65.12 
 
 
308 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  67.35 
 
 
309 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  58.75 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  55.92 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  55.92 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  50 
 
 
308 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  37.01 
 
 
317 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  40.98 
 
 
312 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.61 
 
 
329 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  38.26 
 
 
330 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 
330 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  38.31 
 
 
330 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.64 
 
 
329 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  38.64 
 
 
329 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  38.64 
 
 
329 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.31 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.19 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
328 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  36.94 
 
 
324 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  36.01 
 
 
327 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  37.34 
 
 
329 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.69 
 
 
308 aa  142  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.77 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  32.25 
 
 
320 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  36.81 
 
 
330 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  36.98 
 
 
330 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  37.42 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  35.69 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 
313 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.96 
 
 
323 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  31 
 
 
309 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.72 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  29.22 
 
 
310 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  35.71 
 
 
329 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
319 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.8 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  35.06 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  32.2 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  33.88 
 
 
316 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 
325 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.66 
 
 
323 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  35.08 
 
 
339 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.13 
 
 
320 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 
320 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  33.21 
 
 
306 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.39 
 
 
322 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  33.88 
 
 
316 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.74 
 
 
309 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 
311 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.55 
 
 
309 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  33.65 
 
 
317 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  33.9 
 
 
322 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.46 
 
 
309 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.13 
 
 
309 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  37.78 
 
 
301 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
313 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  33.56 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  34.93 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  33.98 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.13 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  30.13 
 
 
309 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.13 
 
 
309 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.13 
 
 
309 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
309 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.47 
 
 
309 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  30.13 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  35.41 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  30.13 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  34.43 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  34.27 
 
 
315 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  33.22 
 
 
314 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.22 
 
 
305 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  32.54 
 
 
305 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>