More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2278 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  100 
 
 		 327 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  93.69 
 
 		 327 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  84.57 
 
 		 320 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  79.74 
 
 		 330 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  79.42 
 
 		 330 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  79.1 
 
 		 330 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  79.42 
 
 		 330 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  78.78 
 
 		 330 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  79.29 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  78.14 
 
 		 330 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  76.53 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  77 
 
 		 329 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  75.16 
 
 		 329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.16 
 
 		 329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  76.13 
 
 		 329 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  75.16 
 
 		 329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.16 
 
 		 329 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  66.13 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  63.61 
 
 		 314 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  65.36 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  60.59 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  62.09 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  61.69 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  62.01 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  61.11 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  59.34 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  60 
 
 		 316 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  58.39 
 
 		 314 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  59.21 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  57.51 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  58.39 
 
 		 315 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  56.91 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  52.7 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  53.5 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  40.52 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.59 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.33 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.59 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  42.86 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  37.74 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  35.87 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  36.73 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  38.48 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.55 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  35.92 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  37 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  39.55 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  36.91 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  34.75 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  38.29 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  35.55 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  36.81 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  34.19 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  38.51 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.15 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.99 
 
 		 291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.78 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.74 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.09 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.54 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.49 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  32.14 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  32.14 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  34.6 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.04 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.58 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.77 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  35.44 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  35.69 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.94 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.6 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  30.58 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.05 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  34.31 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  30.25 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  36.33 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  32.85 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  36.01 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  34.31 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  36.01 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  36.01 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  36.01 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  36.01 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  36.01 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  32.42 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.71 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  30.4 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.17 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>