More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0836 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0836  PfkB  100 
 
 		 315 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  42.71 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  42.47 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  39.19 
 
 		 313 aa  222  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.46 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.25 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.83 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.36 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.24 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.86 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  37.86 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.86 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  37.86 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.86 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.86 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  38.56 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.86 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  38.56 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.7 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.13 
 
 		 322 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.79 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.79 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  37.79 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  37.79 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.69 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  34.87 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  37.7 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  36.72 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  35.2 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.58 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  34.1 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.7 
 
 		 290 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  35.22 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  35.67 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  37 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  34.87 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.1 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  37.05 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  35.69 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.09 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  36.82 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.87 
 
 		 325 aa  168  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.79 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.76 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  33.78 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  34.45 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  36.95 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.78 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.22 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  35.22 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.77 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  35.06 
 
 		 297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.95 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  40.54 
 
 		 153 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.74 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.32 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.09 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.54 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.54 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  29 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  31.52 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  32.46 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.84 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  30.3 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  27.66 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  25.83 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.37 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.41 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  29.96 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  29.45 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  30.11 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  29.45 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.7 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01490  putative ketodeoxygluconokinase  36.48 
 
 		 172 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.72 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  27.4 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  30.66 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  30.66 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.48 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  30.69 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  27.96 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>