More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2336 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 
316 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  92.06 
 
 
316 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  81.94 
 
 
312 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  78.41 
 
 
308 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  79.4 
 
 
308 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  76.41 
 
 
308 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  78.41 
 
 
308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  78.41 
 
 
308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  77.74 
 
 
308 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  77.74 
 
 
308 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  76.74 
 
 
308 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  80.73 
 
 
308 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  80.73 
 
 
308 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  80.73 
 
 
308 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  80.4 
 
 
308 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  80.4 
 
 
308 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  80.4 
 
 
308 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  80.4 
 
 
308 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  69.77 
 
 
311 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  68 
 
 
311 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  68 
 
 
308 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  68 
 
 
308 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  70.07 
 
 
309 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  61.22 
 
 
309 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  53.29 
 
 
308 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  53.29 
 
 
308 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  49.66 
 
 
308 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  35.83 
 
 
317 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  38.82 
 
 
312 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  36.01 
 
 
330 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  36.01 
 
 
330 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 
330 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.95 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 
330 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 
328 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.77 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.69 
 
 
329 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.05 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  34.52 
 
 
330 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  35.05 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.41 
 
 
330 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  35.05 
 
 
329 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.33 
 
 
312 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  35.35 
 
 
327 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.73 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.76 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  35.35 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33.44 
 
 
329 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  34.31 
 
 
339 aa  139  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 
320 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  32.12 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  28.66 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  33.99 
 
 
345 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
325 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.91 
 
 
322 aa  133  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.19 
 
 
308 aa  132  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  30.26 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  36.23 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.27 
 
 
313 aa  129  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.8 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  32.04 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.88 
 
 
309 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  35.84 
 
 
320 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  33.75 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.3 
 
 
322 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  30.94 
 
 
314 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 
310 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  33.11 
 
 
316 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
313 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  33.44 
 
 
316 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 
319 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  31.41 
 
 
317 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.21 
 
 
331 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.68 
 
 
320 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.55 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  31.89 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.84 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.58 
 
 
306 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.13 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  35.98 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.01 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  32.47 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  33.98 
 
 
326 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 
311 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.91 
 
 
320 aa  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  32.54 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.14 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  31.8 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  28.66 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 
316 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.53 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.53 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.53 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.59 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>