More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1746 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  98.79 
 
 
330 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  98.79 
 
 
330 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  95.15 
 
 
330 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  93.03 
 
 
330 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  94.24 
 
 
330 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  89.39 
 
 
328 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  80.56 
 
 
329 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  80.56 
 
 
329 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  81.17 
 
 
329 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  80.56 
 
 
329 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  80.56 
 
 
329 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  80.56 
 
 
329 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  80.76 
 
 
329 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  79.87 
 
 
327 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  78.78 
 
 
327 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  75.24 
 
 
320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  65.91 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  63.87 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  63.4 
 
 
314 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  60.43 
 
 
345 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  65.36 
 
 
316 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  61.39 
 
 
316 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  63.73 
 
 
316 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  64.05 
 
 
316 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  61.36 
 
 
316 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  61.94 
 
 
324 aa  355  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  60.06 
 
 
314 aa  349  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  61.76 
 
 
316 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  59.8 
 
 
306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  59.09 
 
 
317 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  59.35 
 
 
315 aa  342  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  56.63 
 
 
340 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  52.6 
 
 
319 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.08 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.87 
 
 
320 aa  231  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  38.51 
 
 
313 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  45.31 
 
 
317 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.67 
 
 
320 aa  222  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  42.33 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  38.36 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  38.73 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 
301 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  39.16 
 
 
314 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  39.41 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  36.27 
 
 
314 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  39.68 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  39.21 
 
 
344 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  37.54 
 
 
315 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  39.24 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.77 
 
 
320 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  41.85 
 
 
321 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  40.13 
 
 
318 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  36.73 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.77 
 
 
316 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.39 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  36.67 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  34.81 
 
 
308 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  34.81 
 
 
308 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  35.37 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.49 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  34.49 
 
 
308 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  32.18 
 
 
313 aa  132  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.38 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.12 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  34.84 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  37.26 
 
 
308 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  39.33 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  35.22 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.14 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.02 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.33 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  38.64 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  38.64 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  38.64 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  34.2 
 
 
308 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  36.26 
 
 
309 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  36.51 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  37.14 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  36.45 
 
 
342 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.12 
 
 
312 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  38.31 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  38.31 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  38.31 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  38.31 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  35.03 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  32.85 
 
 
311 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  37.87 
 
 
320 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  34.71 
 
 
308 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  29.37 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  28.43 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.47 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.72 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>