More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2482 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  57.78 
 
 		 315 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  59.15 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  57.61 
 
 		 313 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  54.37 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  52.75 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  52.61 
 
 		 320 aa  318  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  48.37 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  46.75 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  46.43 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  47.4 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  43.59 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  42.48 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  49.35 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  42.24 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  45.78 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  45.78 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  45.45 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  44.81 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  44.81 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  44.81 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  43.77 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  44.16 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  42.86 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  41.69 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  44.48 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  44.48 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  44.16 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  44.16 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  44.16 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  44.16 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  44.16 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  38.31 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  42.42 
 
 		 271 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.96 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.53 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.17 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.92 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.66 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  39.45 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  36.02 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  36.02 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  36.02 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.56 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  35.17 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.6 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 322 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  35.59 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  36.4 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.45 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.45 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  33.19 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  28.01 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.95 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 		 308 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.31 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  36.57 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  36.57 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  30.67 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  36.57 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  36.57 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  38.99 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  38.99 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  38.99 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.08 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  29.3 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.49 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.85 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  28.98 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  29.56 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  27.82 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  31.13 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.85 
 
 		 304 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 319 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 319 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  30.68 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  29.63 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.44 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.24 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  29.84 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.43 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.71 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  26.91 
 
 		 642 aa  89.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.59 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>