More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0290 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  100 
 
 
325 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  91.69 
 
 
325 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  67.38 
 
 
326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  53.38 
 
 
313 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  50.8 
 
 
313 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  48.85 
 
 
315 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  49.67 
 
 
311 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  49.02 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  46.43 
 
 
349 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  43.69 
 
 
318 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  43.55 
 
 
313 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  42.57 
 
 
320 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  40.47 
 
 
310 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  46.45 
 
 
323 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  39.03 
 
 
314 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  36.86 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  43.91 
 
 
319 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  43.91 
 
 
319 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  39.68 
 
 
317 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  43.27 
 
 
319 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  43.04 
 
 
318 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  42.72 
 
 
318 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  43.04 
 
 
318 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  43.04 
 
 
318 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  41.67 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  38.03 
 
 
299 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  38.66 
 
 
320 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  39.42 
 
 
318 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  39.42 
 
 
318 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  39.42 
 
 
318 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  39.42 
 
 
318 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  39.42 
 
 
318 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  39.42 
 
 
318 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  39.1 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  38.11 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.82 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 
312 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  33.33 
 
 
314 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.85 
 
 
319 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.02 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  33.46 
 
 
329 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 
308 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  33.09 
 
 
329 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.09 
 
 
329 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.99 
 
 
337 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  31.69 
 
 
330 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  33.46 
 
 
314 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.71 
 
 
329 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  30.88 
 
 
308 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  31.46 
 
 
329 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  31.86 
 
 
330 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 
330 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  29.81 
 
 
327 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.08 
 
 
308 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 
308 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.94 
 
 
330 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.61 
 
 
330 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  30.8 
 
 
316 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 
308 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 
328 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  30.52 
 
 
316 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 
319 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 
319 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.61 
 
 
330 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  30.71 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.13 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.8 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 
308 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.77 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.14 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.95 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.25 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.44 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  29.35 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.94 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  32.45 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.98 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.84 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  30.34 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  30.19 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  31.91 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.4 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.18 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  31.41 
 
 
326 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.58 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.88 
 
 
642 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  30.92 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  30.82 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.65 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  26.32 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.28 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  32.46 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>