More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1737 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  86.35 
 
 		 315 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  78.91 
 
 		 317 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  59.74 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  60.77 
 
 		 320 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  58.39 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  60.7 
 
 		 330 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  60.06 
 
 		 328 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  60.06 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  59.49 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  60.06 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  59.74 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  59.74 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  57.33 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  56.13 
 
 		 314 aa  345  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  57.93 
 
 		 316 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  58.84 
 
 		 329 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  58.84 
 
 		 329 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  58.84 
 
 		 329 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  58.84 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  57.93 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  59.11 
 
 		 329 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  57.28 
 
 		 316 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  56.07 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  57.28 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  57.88 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  55.41 
 
 		 316 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  55.48 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  57.88 
 
 		 329 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  53.72 
 
 		 319 aa  331  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  56.73 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  55.99 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  52.96 
 
 		 319 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  53.2 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.67 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.24 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  39.34 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  41.97 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.35 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  39.74 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  38.13 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  38.8 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  38.92 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  36.81 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  41.42 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.72 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  39.56 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  38.39 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  39.81 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  35.62 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  33.69 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  35.48 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.54 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  38 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  35.13 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.67 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  37.83 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  37.28 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.77 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  34.88 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.49 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  33.93 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  33.73 
 
 		 635 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  33.84 
 
 		 642 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  35.59 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.6 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  38.97 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  34.18 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.34 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 646 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.81 
 
 		 308 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  31 
 
 		 652 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.82 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.82 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.92 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.39 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  34.41 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  31.14 
 
 		 636 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.71 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  30.06 
 
 		 644 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.88 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.88 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  31.71 
 
 		 640 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  31.49 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.63 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  36.89 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  31.16 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.25 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  31.69 
 
 		 645 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  31.65 
 
 		 630 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  28.97 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  29.75 
 
 		 644 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.75 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  35.11 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>