More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01440 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 315 aa  604  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  46.86 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  47.96 
 
 		 344 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  46.5 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  45.6 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  45.81 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  44.44 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  41.72 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  47.63 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  44.44 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  41.38 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  41.97 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  39.54 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  39.41 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  39.81 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  38.24 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  39.48 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  41.47 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  38.1 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  36.19 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  39.61 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  39.16 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  39.16 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.75 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  39.75 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  39.75 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  39.81 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.43 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.61 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  38.58 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  38.54 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  38.83 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  40.8 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  38.03 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  38.51 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  37.62 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  38.76 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.37 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  37.86 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  36.48 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  41.24 
 
 		 339 aa  148  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.35 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  36.13 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.55 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  37.2 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  37.19 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  36.57 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  39.37 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  39.14 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  41.87 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  36.16 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  35.28 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  34.52 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.45 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  36.46 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.61 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.66 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  40.21 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  32.64 
 
 		 646 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  33.56 
 
 		 630 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.45 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 		 636 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  32.04 
 
 		 642 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.31 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.48 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  33.33 
 
 		 645 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 642 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  35.89 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 635 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  30.86 
 
 		 640 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 		 652 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  24.21 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 634 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  24.92 
 
 		 590 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  26.04 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  31.94 
 
 		 634 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  29.12 
 
 		 634 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.71 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.25 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  30.09 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 		 670 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>