More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2739 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 343 aa  702    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  65.98 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  58.89 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  58.48 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  57.89 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  54.84 
 
 		 590 aa  385  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  54.81 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  53.67 
 
 		 339 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  53.37 
 
 		 339 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  47.83 
 
 		 348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  43.58 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  44.48 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  42.11 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.35 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  42.27 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  39.53 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  41.28 
 
 		 342 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.12 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  41.07 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  38.9 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  39.76 
 
 		 339 aa  232  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.26 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  37.54 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.58 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  36.39 
 
 		 339 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  40 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  38.42 
 
 		 366 aa  212  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  37.96 
 
 		 368 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  38.42 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  31.59 
 
 		 343 aa  206  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.72 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  36.73 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  38.7 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  36.42 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  36.23 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  37.29 
 
 		 366 aa  198  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  31.86 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  33.44 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  35.8 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  37.01 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  39.76 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  36.15 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  37.57 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  36.62 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  35.45 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  29.67 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  36.24 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  34.51 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  31.42 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  32.12 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.72 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.72 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  31.72 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  31.12 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  35.61 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.42 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.42 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  31.12 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  30.21 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.91 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  33.72 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.2 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  30.37 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  31.63 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.53 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  26.02 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  29.67 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  27.84 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  28.99 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.1 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  34.48 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  29.54 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  26.59 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.89 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.15 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  25.6 
 
 		 320 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  28.88 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.91 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 326 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  29.91 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.3 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.83 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  34.98 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.51 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  25.85 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  25.53 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.98 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  27.58 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.58 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  26.28 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 324 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>