More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4291 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  100 
 
 
342 aa  656    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  52.65 
 
 
320 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  52.41 
 
 
344 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  45.72 
 
 
318 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  47.31 
 
 
329 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  45.1 
 
 
315 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  44.69 
 
 
323 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  42.39 
 
 
301 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  39.82 
 
 
314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  41.48 
 
 
301 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  43.28 
 
 
326 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  42.86 
 
 
321 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  38.71 
 
 
311 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  40.07 
 
 
319 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  35.99 
 
 
317 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  42.68 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  38.65 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  40.97 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  37.83 
 
 
318 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  37.62 
 
 
317 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  36.96 
 
 
320 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  38.24 
 
 
339 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  36.25 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 
319 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.28 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 
330 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  37.42 
 
 
330 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 
330 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  35.92 
 
 
306 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  40.33 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  36.13 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  41.87 
 
 
321 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  36.02 
 
 
314 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  36.77 
 
 
316 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 
308 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  34.86 
 
 
317 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  36.33 
 
 
330 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  33.99 
 
 
317 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  34.87 
 
 
317 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  34.85 
 
 
321 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  34.58 
 
 
332 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  35.92 
 
 
316 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  36.01 
 
 
316 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.91 
 
 
308 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  35.62 
 
 
314 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  28.03 
 
 
338 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  36.45 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  31.38 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.92 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  34.42 
 
 
327 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  35.69 
 
 
329 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  35.37 
 
 
316 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  31.38 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.08 
 
 
313 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  32.7 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  37.93 
 
 
312 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  36.25 
 
 
316 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.91 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.91 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.91 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  33.1 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.91 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  34.26 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  36.27 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  36.97 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  35.92 
 
 
316 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  36.01 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  37.98 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.57 
 
 
308 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.57 
 
 
308 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.42 
 
 
313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  36.4 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  36.27 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  36.28 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.28 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  36.59 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.28 
 
 
329 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.66 
 
 
329 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  36.4 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  38.17 
 
 
363 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  27.83 
 
 
342 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  34.53 
 
 
319 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  36.71 
 
 
309 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.62 
 
 
270 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  27.24 
 
 
590 aa  106  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 
315 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
339 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.28 
 
 
345 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.21 
 
 
326 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 
312 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.43 
 
 
329 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 
316 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.54 
 
 
320 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  36.78 
 
 
311 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.05 
 
 
308 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  29.54 
 
 
343 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.05 
 
 
308 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>