More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2275 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  100 
 
 		 342 aa  692    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  98.25 
 
 		 342 aa  681    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  61.58 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  59.36 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  59.65 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  60.7 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  55.72 
 
 		 590 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  57.89 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  53.82 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  47.67 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  45.06 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  42.27 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  41.11 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.9 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  41.44 
 
 		 331 aa  269  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  43.31 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  40.99 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  36.55 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  37.98 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.55 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  39.83 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  36.6 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  35.12 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  41.24 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  37.1 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  36.02 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  38.94 
 
 		 372 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  39.04 
 
 		 339 aa  205  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  38.76 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.9 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  36.03 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.24 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.63 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  34.44 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  38.2 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  37.94 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 		 344 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  38.27 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  38.08 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  35.52 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  31.12 
 
 		 338 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  36.72 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  34.83 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  37.09 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  30.84 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  30.55 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  35.21 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  30.26 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  30.26 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.55 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  35.09 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  30.55 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  30.26 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.97 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  37.9 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.87 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  26.96 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  31.94 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  30.09 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  31.74 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.79 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  29.82 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.53 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.88 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  30.54 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  24.05 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.79 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  27.96 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.82 
 
 		 308 aa  85.9  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.48 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  34.48 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  30.79 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  32.75 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  26.55 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  26.71 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.17 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  26.41 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  29.22 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  25.48 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  24.45 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  27.42 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>