More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0669 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  717    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  41.86 
 
 
348 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.35 
 
 
341 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  37.8 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  36.28 
 
 
340 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  39.14 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  35.42 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  32.27 
 
 
342 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  32.27 
 
 
342 aa  222  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  35.48 
 
 
590 aa  218  7.999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  34.9 
 
 
340 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  33.14 
 
 
340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  33.53 
 
 
340 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  33.43 
 
 
341 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  36.6 
 
 
342 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
339 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
339 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  34.83 
 
 
332 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  31.59 
 
 
343 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  34.53 
 
 
342 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  33.73 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  31.58 
 
 
351 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  33.03 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.94 
 
 
334 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  32.92 
 
 
331 aa  176  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  32.85 
 
 
339 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.54 
 
 
340 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  30.13 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  32.27 
 
 
339 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 
329 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  30.89 
 
 
342 aa  155  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  29.38 
 
 
337 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.29 
 
 
342 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.82 
 
 
341 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  29.91 
 
 
318 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 
344 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  30.38 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  31.04 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  29.5 
 
 
317 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  27.98 
 
 
338 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.53 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.53 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  28.61 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  28.61 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  27.54 
 
 
317 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  27.33 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  27.93 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.93 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  28.74 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  26.29 
 
 
366 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  27.03 
 
 
338 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  30.94 
 
 
326 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  26.7 
 
 
368 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  27.03 
 
 
338 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.44 
 
 
335 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  26.13 
 
 
338 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  30.41 
 
 
321 aa  119  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  26.73 
 
 
317 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  25.43 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  27.54 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  24.79 
 
 
365 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  23.73 
 
 
372 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  25.75 
 
 
360 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  25 
 
 
320 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  24.48 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  24.08 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  22.83 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.45 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  26.59 
 
 
323 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.01 
 
 
339 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  24.5 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  23.77 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  23.96 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  28.24 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  25.54 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.32 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  24.61 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  27.8 
 
 
319 aa  77  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  24.76 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  23.01 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  23.28 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  23.69 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  21.69 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  22.46 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  23.36 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  23.77 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  25.84 
 
 
312 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  23.27 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  22.33 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25.24 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  24.32 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  21.82 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  25.15 
 
 
644 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  22.04 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  23.73 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>