More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0398 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  100 
 
 		 339 aa  690    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  95.87 
 
 		 339 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  39.53 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  37.18 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.5 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  36.6 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  35.26 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.31 
 
 		 342 aa  210  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  33.04 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  33.62 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  36.67 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  34.68 
 
 		 590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  34.49 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  35.44 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  34.68 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  37.89 
 
 		 335 aa  193  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.13 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 348 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.55 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.73 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  30.75 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  32.49 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  32.85 
 
 		 343 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  30.63 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  31.02 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  32.24 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  28.99 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  29.79 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.72 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.29 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  30.32 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  30.32 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  30.29 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  29.71 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  29.71 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  30.37 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.43 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  30.43 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  31.55 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  28.92 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  28.32 
 
 		 351 aa  139  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  30.37 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  30.5 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.08 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.24 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  28.95 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  25.22 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  30.61 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  30.29 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  28.98 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  27.19 
 
 		 317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  27.71 
 
 		 331 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 365 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  30.06 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  31.62 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.73 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  25.72 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  27.03 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  27.79 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  26.91 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  28.07 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.22 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.58 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  27.08 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  24.23 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.4 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  26.78 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  24.49 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.58 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  26.93 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  24.2 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.21 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  24.84 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  27.74 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  23.65 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  23.3 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.41 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  25.1 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  24.67 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  24.68 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  23.23 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  24.1 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  25.47 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  23.42 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.33 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>