296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11458 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  100 
 
 
341 aa  710    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  69.79 
 
 
348 aa  504  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  41.76 
 
 
330 aa  285  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  42.98 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  42.73 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  42.9 
 
 
342 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  43.35 
 
 
343 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  38.57 
 
 
331 aa  268  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  40.12 
 
 
340 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  43.73 
 
 
590 aa  262  6e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  43.57 
 
 
341 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  37.35 
 
 
343 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  40.06 
 
 
339 aa  239  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  40.06 
 
 
339 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  40.53 
 
 
332 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  37.61 
 
 
340 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  37.73 
 
 
331 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  36.42 
 
 
342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  35.69 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  37.06 
 
 
338 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.82 
 
 
334 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  34.53 
 
 
342 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  36.15 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.92 
 
 
342 aa  193  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.54 
 
 
340 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  35.15 
 
 
342 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.65 
 
 
341 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 
329 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  34.63 
 
 
331 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  32.65 
 
 
334 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  32.01 
 
 
339 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  32.67 
 
 
351 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  31.73 
 
 
339 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  31.95 
 
 
337 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  31.9 
 
 
366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  33.04 
 
 
336 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  30.88 
 
 
338 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 
344 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.9 
 
 
338 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 
365 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.61 
 
 
338 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.61 
 
 
338 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.61 
 
 
338 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.75 
 
 
338 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  30.75 
 
 
338 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  31.41 
 
 
338 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  31.12 
 
 
338 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  31.03 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  30.48 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  30.75 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  30.5 
 
 
366 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  29.89 
 
 
365 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.91 
 
 
335 aa  142  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  30.66 
 
 
367 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  30.77 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  31.03 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  30.7 
 
 
360 aa  139  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  30.23 
 
 
359 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  30.26 
 
 
326 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.89 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  28.74 
 
 
317 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  28.82 
 
 
321 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  26.71 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.32 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  27.16 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.01 
 
 
317 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  27.74 
 
 
321 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  27.49 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  24.93 
 
 
319 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  27 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  25.23 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  29.11 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  31.58 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  26.26 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.04 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  26.3 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  24.04 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  25.24 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  24.04 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  26.16 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  23.75 
 
 
301 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  27.27 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.27 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  22.9 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  23.88 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  23.76 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  23.45 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  24.77 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  24.21 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  24.03 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  25 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.74 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  22.49 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  27.24 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  23.47 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>